Thay đổi môi trường sống (xem: phân chia sinh cảnh hoặc phá hủy môi trường sống) là động lực quan trọng nhất hiện nay ảnh hưởng đến đa dạng sinh học, vì khoảng 40% rừng và môi trường sống không bị đóng băng đã được chuyển đổi thành đất trồng trọt hoặc đồng cỏ.[13] Các nguyên nhân khác là: khai thác quá mức, ô nhiễm, các loài xâm lấn và biến đổi khí hậu.